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Isolation of high-quality dna in 16 aromatic and medicinal colombian species using silica-based extraction columns

Vega Vela, Nelson Enrique and Chacón Sánchez, María Isabel (2011) Isolation of high-quality dna in 16 aromatic and medicinal colombian species using silica-based extraction columns. Agronomía Colombiana, 29 (3). pp. 349-357. ISSN 2357-3732

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URL oficial: http://revistas.unal.edu.co/index.php/agrocol/arti...

Resumen

Aromatic and medicinal plant species are a valuable resource for research and development of pharmaceutical, cosmetic, crop protection and nutritional agents, due to the high amount of bioactive phytochemicals that they contain. However, these compounds are a major obstacle in the isolation of high-quality DNA suitable for genetic analyses. In this paper, we report a protocol that optimizes the use of the cationic detergent CTAB and the reductant β-mercaptoethanol in cell lysis. The elimination of plant secondary metabolites such as polysaccharides and polyphenols, that typically co-isolate with DNA, was achieved using the chemical denaturing properties of the guanidinium cation, which together with the adsorbent chemical specificity of the silica, resulted in the purification of high-quality DNA suitable for digestion with restriction enzymes and optimal for PCR amplification of AFLP-type molecular markers. This protocol was evaluated on 16 Colombian aromatic and medicinal plant species promising for their essential oils. The results allow suggesting that this procedure might be appropriate for other species, tissues and sample types recalcitrant to DNA extraction., Las especies vegetales aromáticas y medicinales son un recurso valioso para la investigación y el desarrollo de agentes farmacéuticos, cosméticos, agrícolas y de alimentos, debido a la alta cantidad de fitoquímicos bioactivos que contienen. Sin embargo, estos compuestos son un obstáculo en el aislamiento de ADN de alta calidad adecuado para análisis genéticos. En el presente artículo reportamos un protocolo que optimiza el uso del detergente catiónico CTAB y el agente reductor β-mercaptoetanol en la lisis celular. La eliminación de metabolitos secundarios como polisacáridos y polifenoles que típicamente co-aíslan con el ADN, se logró utilizando las propiedades químicas desnaturalizantes del catión guanidinio que junto con la especificidad química adsorbente de la sílica, resultó en la purificación de ADN de alta calidad adecuado para la digestión por enzimas de restricción y óptimo para la amplificación por PCR de marcadores moleculares tipo AFLPs. Este protocolo se evaluó en 16 especies vegetales aromáticas y medicinales colombianas promisorias por sus aceites esenciales. Los resultados obtenidos permiten sugerir que este procedimiento podría ser apropiado para su aplicación en otras especies, tejidos y tipos de muestras recalcitrantes a la extracción de ADN.

Tipo de documento:Artículo - Article
Información adicional:© Facultad de Agronomía, Universidad Nacional de Colombia Se autoriza la reproducción y citación del material que aparece en la revista, siempre y cuando se indique de manera explícita: nombre de la revista, nombre del autor(es), año, volumen, número y páginas del artículo fuente. Las ideas y afirmaciones consignadas por los autores están bajo su responsabilidad y no interpretan necesariamente las opiniones y políticas de la Universidad Nacional de Colombia. La mención de productos o firmas comerciales en la revista no implica una recomendación o apoyo por parte de la Universidad ni de la Facultad; el uso de tales productos debe ceñirse a las recomendaciones de las etiquetas.
Palabras clave:chaotropic agent, guanidinium cation, silica-based extraction columns, nucleic acid extraction kit, guanidinium salts, molecular markers.
Temática:6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Unidad administrativa:Revistas electrónicas UN > Agronomía Colombiana
Código ID:25948
Enviado por : Dirección Nacional de Bibliotecas STECNICO
Enviado el día :27 Junio 2014 17:07
Ultima modificación:27 Mar 2019 17:26
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