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Estudio de la variabilidad genética en materiales comerciales de gulupa (Passiflora edulis f. edulis Sims) en Colombia / Evaluation of genetic variability in gulupa (Passiflora edulis f. edulis Sims) from commercial materials in Colombia

Ortiz Vallejo, Diana Carolina (2010) Estudio de la variabilidad genética en materiales comerciales de gulupa (Passiflora edulis f. edulis Sims) en Colombia / Evaluation of genetic variability in gulupa (Passiflora edulis f. edulis Sims) from commercial materials in Colombia. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.

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Resumen

En este estudio se evaluó la variación intraespecífica en gulupa (Passiflora edulis f. edulis Sims) a nivel del DNA, usando los marcadores moleculares AFLPs y SSRs. Se colectaron 60 materiales de gulupa procedentes de cultivos comerciales ubicados en los departamentos de Cundinamarca, Boyacá, Huila, Tolima, Quindío y Antioquia. Adicionalmente, se incluyeron diez materiales del Banco de Germoplasma de Passifloracea de Corpoica La Selva. Como testigos se empleó una planta de gulupa no cultivada comercialmente y tres especies ubicadas dentro del género Passiflora: maracuyá, cholupa y granadilla. De las 49 combinaciones de primers selectivos de AFLPs evaluados se seleccionaron las seis combinaciones más informativas. Con estas combinaciones se obtuvieron entre 52 y 92 fragmentos por genotipo para un total de 419 fragmentos. De los 17 primeros de microsatelites reportados para maracuyá ocho de ellos amplificaron con éxito en gulupa pero todos fueron monomórficos. Con el total de los fragmentos obtenidos se construyó un dendograma utilizando el coeficiente de similaridad de Dice y el algoritmo UPGMA. Los coeficientes de similaridad estuvieron en un rango de 0,75-1,00 con un promedio de 0,96 entre los materiales de gulupa con lo cual se evidenció una baja variabilidad genética entre los individuos evaluados. Con base en el análisis de correspondencia múltiple fue posible identificar seis individuos que se diferenciaron del grupo de los materiales evaluados. / Abstract. In this study we evaluated the intraspecific variation in P. edulis f. edulis at DNA level using as molecular markers fragments from AFLPs and SSRs. 60 materials were collected from commercial crops located in Cundinamarca, Boyacá, Huila, Tolima, Quindío and Antioquia. In addition, we included ten materials from the pasiflora Germoplasm Bank of Corpoica La Selva. As controls we included one plant of non-commercial gulupa and three species from the Passiflora genre: Passiflora maliformis, Passiflora edulis f. flavicarpa and Passiflora ligularis. We selected from the initial screening using 49 different AFLPs primers combinations the six more informative. Using these six combinations, we obtained between 52 and 92 DNA fragments for each combination in each genotype for a total of 419 fragments. From the 17 SSRs primers reported to P. edulis f. flavicarpa and Passiflora alata, only eight of them amplified in gulupa. The total fragments obtained were analyzed using the Dice coefficient and UPGMA algorithm. The similarity coefficients ranged between 0,75 and 1,00 with an average of 0,96 between the different gulupa materials, evidencing a low genetic variability in the gulupa materials employed in this study. Based in the multiple correspondence analysis it was possible to identify six individuals different to the other gulupa materials.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Mosquera Vásquez, Teresa and Bohórquez Chaux, Adriana
Información adicional:Magíster en ciencias agrarias, área de énfasis en genética y fitomejoramiento
Palabras clave:Variabilidad genética; AFLPs; SSRs; Análisis cluster; Passiflora edulis f. edulis Sims; Genetic variabitity; Cluster analysis
Temática:6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Unidad administrativa:Sede Bogotá > Facultad de Agronomía
Sede Bogotá > Facultad de Ciencias > Facultad de Agronomía
Código ID:3044
Enviado por : Universidad Nacional de Colombia Biblioteca Digital - Sede Bogotá
Enviado el día :04 Febrero 2011 02:40
Ultima modificación:09 Febrero 2011 22:24
Ultima modificación:09 Febrero 2011 22:24
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