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Analizando datos RNA-Seq en procariotas: una revisión para no expertos

Rodríguez Cubillos, Andrés Eduardo and Perlaza-Jiménez, Laura and Bernal Giraldo, Adriana Jimena (2014) Analizando datos RNA-Seq en procariotas: una revisión para no expertos. Acta Biológica Colombiana, 19 (2). pp. 131-142. ISSN 1900-1649

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URL oficial: http://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/art...

Resumen

La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la ecuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, el alcance de las conclusiones que se pueden sacar depende estrictamente de un proceso adecuado, desde el diseño experimental hasta el análisis bioinformático de los datos. Dadas las diferencias en el proceso transcripcional de las células eucariotas y procariotas, el análisis de RNA-Seq deberá tener ciertas consideraciones dependiendo del tipo de organismo estudiado. En esta revisión se exponen los principales factores a tener en cuenta para lograr un análisis de RNA-Seq consistente, replicable y concluyente, enfocándose específicamente en organismos procariotas., RNA-Seq is nowadays the method of choice for the sequencing of transcripts and transcriptomes in the field of molecular biology and gene expression assays. Until recently, this technique has allowed for the sequencing of RNA transcripts in an unprecedented scale and depth never reached in previous years; nevertheless, the reach and validity of the conclusions generated will depend strictly on an adequate experimental design and a robust analysis of the data. Given the inherent differences between prokaryotes and eukaryotes, the RNA-Seq analysis should take into account the type of organism studied. In this review we present the main factors to take into consideration when designing a consistent analysis for this type of data in prokaryotes, from the experimental design to the in silico analysis of the generated data.

Tipo de documento:Artículo - Article
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Palabras clave:Ciencias biológicas, Biología celular, Biología molecular, Bioinformática, analysis, experimental design, prokaryotes, RNA-Seq, análisis bioinformático, diseño experimental, procariotas, RNA-Seq.
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Unidad administrativa:Revistas electrónicas UN > Acta Biológica Colombiana
Código ID:38327
Enviado por : Dirección Nacional de Bibliotecas STECNICO
Enviado el día :03 Julio 2014 20:16
Ultima modificación:27 Febrero 2019 14:56
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