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Variabilidad genética y fenotípica del Bocachico (Prochilodus magdalenae) de la ciénaga de Zapatosa Cesar

Pacheco Peñaranda, Elianny (2019) Variabilidad genética y fenotípica del Bocachico (Prochilodus magdalenae) de la ciénaga de Zapatosa Cesar. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Palmira.

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Resumen

La ciénaga de Zapatosa (CZ) es un ecosistema de gran importancia en el departamento del Cesar y del Magdalena en Colombia por su gran diversidad de especies animales y vegetales, y por ser una de las principales fuentes de sostenimiento para las familias que viven allí. El escaso conocimiento biológico y genético de las especies ícticas, trae como consecuencia malos manejos de repoblamiento que impactan las especies y el ecosistema. Una de las especies con mayor importancia es el bocachico (Prochilodus magdalenae) el cual se encuentra en estado vulnerable. El objetivo de este proyecto fue estimar la variabilidad genética y fenotípica de esta especie en la CZ del departamento del Cesar. Se colectaron 223 ejemplares de Prochilodus magdalenae en nueve sitios de la CZ. Para la variabilidad fenotípica se realizó morfometría geométrica (MG) utilizando IMP (Integrated Morphometrics Package) y MophoJ. Para los análisis de variabilidad genotípica se usó genotipificación por secuenciación (GBS). Los análisis morfométricos indicaron que la varianza de la forma no estaba influenciada por el dimorfismo sexual o la alometría; los componentes principales explicaron el 62.69% de la varianza y las variables canónicas mostraron una clara diferenciación entre los sitios Pelaya y Tamalameque con los demás sitios de muestreo; el MANOVA indicó que el 45.16% de la varianza es explicada por las diferencias de forma entre grupos. Para los análisis genéticos, se obtuvieron 6277 SNPs polimórficos que mostraron baja diferenciación poblacional, moderada variabilidad genética y alto flujo genético. Se encontró diferenciación a nivel morfológico, pero no a nivel genético entre los sitios de muestreo., The swamp of Zapatosa (CZ) is an ecosystem of great importance in the department of Cesar and Magdalena in Colombia for its great diversity of animal and plant species, and for being one of the main sources of sustenance for the families that live there. The scarce biological and genetic knowledge of the fish species, results in inadequate repopulation management that impacts the species and the ecosystem. One of the most important species is the bocachico (Prochilodus magdalenae) which is in a vulnerable state. The objective of this project was to estimate the genetic and phenotypic variability of this species in the CZ department of Cesar. 223 specimens of Prochilodus magdalenae were collected in nine sites of the CZ. Geometric morphometry (MG) was performed for phenotypic variability using IMP (Integrated Morphometrics Package) and MophoJ. Genotyping by sequencing (GBS) was used for genotypic variability analyzes. Morphometric analyzes indicated that the variance of the form was not influenced by sexual dimorphism or allometry; the main components explained 62.69% of the variance and the canonical variables showed a clear differentiation between the Pelaya and Tamalameque sites with the other sampling sites; the MANOVA indicated that 45.16% of the variance is explained by the differences in form between groups. For genetic analysis, 6277 polymorphic SNPs were obtained that showed low population differentiation, moderate genetic variability and high genetic flux. Differentiation was found at the morphological level, but not at the genetic level between the sampling sites.

Tipo de documento:Tesis/trabajos de grado - Thesis (Maestría)
Colaborador / Asesor:Muñoz Flórez, Jaime Eduardo and Álvarez Franco, Luz Ángela
Información adicional:Linea de investigación en producción animal tropical
Palabras clave:Ciénaga de Zapatosa, Swamp of Zapatosa, GBS, IMP, Geometric morphometry, Prochilodus magdalenae, SNP, Genetic variability, Morfometría geométrica, Prochilodus magdalenae, Variabilidad genética
Temática:5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science > 59 Animales / Animals
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology > 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Unidad administrativa:Sede Palmira > Facultad de Ciencias Agropecuarias > Maestría Ciencias Agrarias
Código ID:74448
Enviado por : Maestría Elianny Pacheco Peñaranda
Enviado el día :30 Septiembre 2019 19:34
Ultima modificación:30 Septiembre 2019 20:02
Ultima modificación:30 Septiembre 2019 20:02
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